PostgreSQL首要任务是要保证数据的完整性。FAT和FAT32文件系统不能提供这样的可靠性保障，而且FAT文件系统缺乏安全性保障，使得保护原始数据无法保证不被未经授权的更改。最后，PostgreSQL使用一项"多分点"的功能来完成表空间功能，这一特性在FAT文件系统下也是无法实现的。
NTFS文件系统是一个日志文件系统，提供了好得多的可靠性和恢复功能，而且它有较全面的访问控制功能，并提供PostgreSQL要用到的多分点功能。
基本上述原因，PostgreSQL安装程序只能在NTFS分区中完成数据库的初始化工作，而PostgreSQL服务器程序自身和一些工具程序可以安装在任何分区中。
然而也要看到，在一些系统中，特别是开发人员的电脑上，也许只有一种FAT分区，在这种情况下，你可以象正常情况下一样安装 PostgreSQL，但不要进行数据库的初始化工作，在安装完成后，在FAT分区上手动执行initdb.exe程序，但安全性和可靠性就不能保证了，并且建立表空间也会失败。