Moodle 课程设计不能简单地套用传统课程设计的思路和方法，而是要充分发挥网络媒体的特长，并要体现当代教育改革精神。
1 总体性原则
就 Moodle 课程设计的总体原则而言，课程应该是基于建构主义学习理论设计开发的。由于网络教育需要学习者更多的时间在网上学习，这就要求网络课程设计更应该把握“以学生为中心”的原则，设计多元化而又富有个性的学习内容和学习方式，引导学习者按照自己的方式去实现意义的建构[4]。以建构主义为指导进行Moodle 课程设计，实质上有两个层面的含义：第一，教师要依据建构主义学习理论进行Moodle 课程的设计与开发，使学习者处于符合建构主义要求的学习情境之中，促进学习者的学习；第二，教师作为Moodle 课程的设计者，在实施网络教学的过程中，要以一个学习者的身份出现，学习任务是“如何更好地设计实施网络课程，达到教学目标，取得良好的教学效果”。除此之外，整个设计过程都要自觉地以建构主义学习理论为指导，有意识地自我构建、创造利于自身“意义建构”的情境。在这里，教师的“意义建构”更多地指学习有关Moodle 课程设计、开发、实施和评价等方面的知识和技能。
2 一般性原则
1.协作学习原则
协作学习强调在学习过程中通过计算机和网络来支持学生之间的交互活动，以小组形式在师生之间、生生之间进行讨论、交流、协作，学生通过合作过程共同完成学习任务。协作学习有助于培养学生的合作精神和协作解决问题的能力。
2.开放性原则
建构主义认为学习者对知识的理解和掌握不应只有一个固定的学习起点，所以设计Moodle 课程时就要从多角度、多层次进行设计，为学习者提供一个开放的学习条件。
3.交互性原则
如果一门网络课程若缺少交互性，那不过是书本教材的电子文档，谈不上什么独特性、优越性。这里的“交互性”有四层含义：一是学生在网上学习时，能随时随地与课程系统之间进行交互；二是学生与学生之间的交互；三是教师与学生之间的交互；四是教师与教师之间的交互。Moodle 课程中设有“讨论区”、“聊天室”、“作业”和“工作坊”等栏目，能够实现课程的交互性。
4.情境性原则
建构主义认为学习者依据自身的经验对学习内容进行改造和重组。因此，在Moodle 课程设计时就要考虑到学习者自身原有的经验，尽量为学习者提供与学习内容相似的真实情境，以帮助学习者在真实的学习情境中积极地进行意义建构，获取知识和技能。如果课程设计脱离学习者的具体实际，学习者是很难将所学内容进行有效迁移的。
5.积极引导原则
兴趣是最好的老师，再好的网络课程也离不开教师的积极引导。在Moodle 课程设计时，要充分考虑到学习者的学习障碍和困难，在课程设计中要对解决这些困难有所考虑。在Moodle 课程设计时也可以咨询学习者的意见和建议，从而根据具体的反馈信息对网络课程进行不断修改和完善，以不断符合学习者的需要。获得反馈信息的方法有问卷调查、组织座谈等。